Flappy Moonbirds es un juego de estilo arcade en el que el jugador controla al pájaro Owlie. Owlie se mueve persistentemente hacia la derecha y el jugador tiene la tarea de navegarlo a través de pares de tubos con huecos colocados a alturas aleatorias. El jugador toca la pantalla táctil para hacer que Owlie ascienda y desciende automáticamente. Cada paso exitoso a través de un par de tubos le otorga al jugador un punto y cada colección exitosa de Ether otorga diez puntos.